Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIPCQ9C0C6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIPCQ9C0C6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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