Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIT2Q99578 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms