Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms