Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 762.1 ms