Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFHD2Q96C19 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms