Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRUQ92729 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms