Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHIPQ8WWQ0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms