Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA6DQ8NFY4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms