Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLIP4Q8N3C7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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