Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms