Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 C15orf38-AP3S2-202ENST00000558648 664 ntTSL 511.41□□□□□ -0.589e-12■■■■■ 28.2
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PRPF8Q6P2Q9 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 28.1
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PRPF8Q6P2Q9 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 28.1
PRPF8Q6P2Q9 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.554e-7■■■■■ 28.1
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