Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EEF1DP3Q658K8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms