Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMPD1Q5SYB0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms