Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTLL9Q3SXZ7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms