Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms