Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFX4Q33E94 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms