Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F4Q16254 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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