Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TWIST1Q15672 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms