Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms