Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA2Q15560 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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