Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RSU1Q15404 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RSU1Q15404 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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