Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDCD1Q15116 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms