Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIXQ14938 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms