Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPSQ13938 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms