Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPTAN1Q13813 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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