Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL1Q13616 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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