Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PPP1R1AQ13522 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PPP1R1AQ13522 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PPP1R1AQ13522 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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PPP1R1AQ13522 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PPP1R1AQ13522 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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