Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB3Q13509 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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