Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
UBE2V1Q13404 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms