Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SP140Q13342 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP140Q13342 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SP140Q13342 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SP140Q13342 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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