Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NR1H3Q13133 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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NR1H3Q13133 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NR1H3Q13133 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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