Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms