Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALD1Q05682 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms