Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms