Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms