Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms