Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IRX1P78414 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms