Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms