Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VBP1P61758 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VBP1P61758 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms