Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPD52P55327 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms