Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms