Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACLYP53396 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACLYP53396 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACLYP53396 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms