Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A2P52657 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms