Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRPC1P48995 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRPC1P48995 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms