Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A2P43354 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.9 ms