Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTR1BP42025 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms