Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGP37231 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGP37231 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGP37231 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms