Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNA7P36544 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms