Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6V1E1P36543 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms