Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARID4AP29374 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARID4AP29374 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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